在脊推动物中，只有鱼类和圆口纲是终生用鳃呼吸的水生动物，但鱼类的鳃是由外胚层发生形成，圆口类的鳃起源于内胚层。鱼类一般具有5对鳃弓（少数鱼有6～7对），在咽部两侧各有5个鳃裂。鳃主要由鳃弓、鳃隔、鳃瓣等几部分组成。鳃弓起支持作用，它的内侧缘着生鳃耙，进出鳃的血管都从鳃弓上通过，鳃弓的外侧缘是鳃隔，鳃隔前后突起形成鳃经，无数鳃经紧密排列成栉状鳃瓣，鳃丝上的无数小突起称鳃小叶，是气体交换之处。鳃小叶上布满毛细血管，血液最后流入窦状隙内，窦状隙的壁由结缔组织组成，起支持作用，鳃小叶的表层为单层上皮细胞，故鱼鳃呈鲜红色。硬骨鱼类的鳃较原始，鳃裂开口于体内，鳃隔发达，前后各有1个半鳃，这两个半鳃总称全鳃，外侧有鳃盖保护，鳃盖下面的内侧为鳃腔或鳃室，以一个总鳃孔向后开口于体外。鳃盖后缘延伸有柔软的鳃盖膜，能将鳃孔紧紧地封住。软骨鱼类有4个全鳃，1个半鳃，共九对半鳃，无鳃盖。